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液体活检测试可以识别可能对免疫检查点阻断有反应的患者

然而,该研究的主要作者Georgiadis解释说,检测MSI-H和dMMR状态通常具有挑战性。目前,使用组织活检和诸如基于PCR的扩增或下一代测序的技术检测MSI。他补充说,这些过程很复杂,并且具有灵敏度限制,某些肿瘤样本缺乏足够的组织进行准确测试。

“评估MSI的液体活检测试可以覆盖更多的患者,例如那些组织受限或有额外手术干预存在安全问题的患者,”Georgiadis说。

研究如何进行和结果:在这项研究中,研究人员试图评估个人基因组诊断开发的液体活检方法的敏感性和特异性。他们开发了一个98kb的泛癌58基因组,然后采用多因子纠错方法和一种新的峰发现算法来鉴定无细胞DNA(cfDNA)中的MSI移码等位基因。该研究基于61名患有晚期癌症的患者和来自健康个体的163份血浆样本。

作者解释说,与正常DNA相比,可以通过测量肿瘤DNA中改变的微卫星序列的长度来检测MSI。在这项研究中,研究人员标记了某些序列数据以进行纠错,然后将数据置于峰值发现算法中,该算法识别出基因座的不稳定性。如果确定20%或更多的基因座具有MSI,则将样品分类为MSI高。

对于TMB,处理下一代测序数据,并使用VariantDx软件鉴定变体。研究人员在靶向血浆组中设置了5个突变,作为识别肿瘤具有异常高突变负荷的阈值。

对于MSI,该测试产生的特异性大于99%,灵敏度为78%。对于TMB,该测试产生的特异性大于99%,灵敏度为67%。

研究人员还从29例转移性癌症患者中获得了血浆,包括结肠直肠癌,壶腹癌,小肠癌,子宫内膜癌,胃癌和甲状腺癌。其中,基于档案组织的分析将23例MSI高分为6例,微卫星稳定分为6例。VariantDx检测在23例MSI高患者中有18例(78.3%)检测到高MSI,并正确识别出6例微卫星稳定病例。

研究人员发现,在基线cfDNA中直接检测MSI与正在接受免疫检查点封锁治疗的患者的无进展生存期相关。总体生存率的改善没有统计学意义。

作者的评论:“我们的数据还表明,MSI和TMB的液体活检分析可能比档案组织更能预测免疫治疗反应,因为它既是实时测量又是全局测量,可以解决组织活检的固有采样偏差,” Georgiadis说。

作者Le说,如果这项研究的结果得到进一步验证并且测试可以商业化,那么更多的患者可以从免疫检查点抑制剂中受益。

“大多数患有MSI高肿瘤的晚期无法治愈的癌症患者应该选择接受免疫治疗,”她说。“如果测试变得更容易获得,成本更低,并且需要更少的资源,例如组织采集和病理资源,那么可以测试更多的患者。”

研究限制:作者指出,该研究仅限于少数癌症患者。为确认研究结果,有必要对更广泛的肿瘤类型进行进一步的研究。

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