Science

植物&动物 | 生态&环境 | 大脑&行为 | 健康 | 技术 | 科学&政策 | 进化 | 古生物学 | 细胞 | 分子 | 基因&蛋白 | 遗传&发育 | 生物化学 | 生物物理 | 免疫 | 人物&事件 | 微生物学 |
当前位置: Science » 基因&蛋白 » Science:美科学家发表心血管相关基因组测序分析研究论文

Science:美科学家发表心血管相关基因组测序分析研究论文

摘要 : 2016年8月19日,国际顶尖学术期刊《Science》杂志上在线发表了美国西奈山伊坎医学院基因与多尺度生物系Johan L. M. Björkegren研究员的一篇研究论文,研究通过全基因组关联研究(GWAS)鉴定了数百个心血管疾病的风险位点同时对六百名冠心病患者的不同组织进行了基因分型和RNA测序。

2016年8月19日,国际顶尖学术期刊《Science》杂志上在线发表了美国西奈山伊坎医学院基因与多尺度生物系Johan L. M. Björkegren研究员的一篇研究论文,研究通过全基因组关联研究(GWAS)鉴定了数百个心血管代谢疾病(CMD)的风险位点同时对六百名冠心病患者的不同组织进行了基因分型和RNA测序。

Johan Björkegren教授表示:“通过分析多个组织的基因表达数据,我们鉴定了在单一组织起作用的致病基因,也发现了以网络形式跨组织起作用的致病基因”。

这是首次对冠心病(CAD)患者血液、血管和代谢组织的RNA序列进行系统性分析。“全基因组关联研究鉴定了大量会提升CAD风险的DNA变异,”Dr. Björkegren。“然而,全基因组关联研究只是了解CAD的第一步,要将风险指标转化为新的诊疗机遇,我们必须迈入下一个阶段,找到受这些DNA变异影响而推动疾病发展的基因。此外,我们也需要了解疾病基因在哪些组织、通路和分子网络中起作用。

研究人员在冠状动脉搭桥手术中收集了600名CAD患者的一些关键组织。他们发现,这些组织中的基因表达数据能够提供宝贵的信息,不仅可以揭示CAD致病基因及其活性,对研究其他心血管代谢疾病和阿尔茨海默症也很有帮助。

“我们惊讶的发现,除了肝脏以外,腹部脂肪对于调控血脂水平也很关键,”文章第一作者Oscar Franzén博士说。“举例来说,控制低密度脂蛋白(LDL)血液水平的PCSK9基因居然是在腹部脂肪中起作用的,而不是在调控血脂水平的主要场所——肝脏。” 最近,PCSK9作为降脂药物的新靶标受到了很大的关注。

基础研究项目有助于探索CAD和其他复杂疾病的病因,“此前GWAS鉴定了不少DNA位点,我们明确了这些位点影响的基因。研究显示,许多基因所在的调控网络涉及多种组织和疾病,”文章的另一位资深作者Eric Schadt教授说。现在研究人员正在与阿斯利康和SciLifeLab合作,尝试开发新的药物靶标。

原文链接:

Cardiometabolic risk loci share downstream cis- and trans-gene regulation across tissues and diseases

原文摘要:

Genome-wide association studies (GWAS) have identified hundreds of cardiometabolic disease (CMD) risk loci. However, they contribute little to genetic variance, and most downstream gene-regulatory mechanisms are unknown. We genotyped and RNA-sequenced vascular and metabolic tissues from 600 coronary artery disease patients in the Stockholm-Tartu Atherosclerosis Reverse Networks Engineering Task study (STARNET). Gene expression traits associated with CMD risk single-nucleotide polymorphism (SNPs) identified by GWAS were more extensively found in STARNET than in tissue- and disease-unspecific gene-tissue expression studies, indicating sharing of downstream cis-/trans-gene regulation across tissues and CMDs. In contrast, the regulatory effects of other GWAS risk SNPs were tissue-specific; abdominal fat emerged as an important gene-regulatory site for blood lipids, such as for the low-density lipoprotein cholesterol and coronary artery disease risk gene PCSK9. STARNET provides insights into gene-regulatory mechanisms for CMD risk loci, facilitating their translation into opportunities for diagnosis, therapy, and prevention.

来源: Science 浏览次数:1

我们欢迎生命科学领域研究成果、行业信息、翻译原创、实验技术、采访约稿。-->投稿

RSS订阅 | 生物帮 | 粤ICP备11050685号-3 ©2011-2014 生物帮 Science  All rights reserved.