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Science:全球首份癌症病例图谱发布

摘要 : 日前,《科学》杂志刊登了瑞典科学家的重磅成果——全球首份癌症病例图谱“Atlas”,将数千种特定癌症相关基因与患者生存情况联系起来,发掘出32种不以癌症类型分类、但与80%人类癌症相关的“公共”基因,可作为潜在新药研发的精准靶点。

日前,《科学》杂志刊登了瑞典科学家的重磅成果——全球首份癌症病例图谱“Atlas”,将数千种特定癌症相关基因与患者生存情况联系起来,发掘出32种不以癌症类型分类、但与80%人类癌症相关的“公共”基因,可作为潜在新药研发的精准靶点。新图谱被认为是肿瘤临床实践革命性改进的重要推手。

据《麻省理工技术评论》杂志官网等外媒报道,Atlas图谱可开放获取,仍在继续努力收集公共数据,目标是收集可用于开发癌症药物和诊断方法的实用信息,比如疾病标志物等。

瑞典皇家理工学院教授马瑟尔斯·阿合雷是欧洲生物技术联合会主席,也是Atlas项目的领导者,他带领科研团队使用超级计算机,分析了8000种肿瘤样本中的17种主要类型的人类癌症,并使用RNA测序方法,了解基因在受癌症影响时发生的变化,积极寻求“基因突变导致的基因组整体变化”。

研究人员确定了2000多个抑制肿瘤生长的基因,但绝大多数基因靶向药物会同步产生强烈的副作用。经筛选,发现其中32种基因存在于超过80%的肿瘤样本中,且与癌症具体类型无关,它们可以作为新药研发的靶子。

此外,依据肿瘤类型和肿瘤位置,研究人员还发现,超过2000种基因对病人生存率等“预后”有着不同的影响。他们还进一步将这些“预后”基因分为“有利于预后”和“不利于预后”两类。而以往对“预后”基因的研究屈指可数。

原文链接:

A pathology atlas of the human cancer transcriptome

原文摘要:

 

Recent initiatives such as The Cancer Genome Atlas have mapped the genome-wide effect of individual genes on tumor growth. By unraveling genomic alterations in tumors, molecular subtypes of cancers have been identified, which is improving patient diagnostics and treatment. Uhlen et al. developed a computer-based modeling approach to examine different cancer types in nearly 8000 patients. They provide an open-access resource for exploring how the expression of specific genes influences patient survival in 17 different types of cancer. More than 900,000 patient survival profiles are available, including for tumors of colon, prostate, lung, and breast origin. This interactive data set can also be used to generate personalized patient models to predict how metabolic changes can influence tumor growth.

来源: Science 浏览次数:0

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