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非洲人携带的尼安德特人DNA比以前想象的要多

导读 美国研究人员团队使用一种新颖的方法来检测现代人的尼安德特人血统,证明尼安德特人基因组的残留物可以在迄今为止研究的每个现代人中生存。...

美国研究人员团队使用一种新颖的方法来检测现代人的尼安德特人血统,证明尼安德特人基因组的残留物可以在迄今为止研究的每个现代人中生存。他们发现现代非洲人的尼安德特人DNA比以前想象的要多。这可以用真正的尼安德特人血统来解释,因为他们主要是从祖先欧洲人迁移回非洲。

普林斯顿大学的科学家约书亚·阿基(Joshua Akey)博士说:“我们的研究意义重大,因为它为了解人类历史和全球不同人群的尼安德特人血统的方式提供了重要的新见解。”

“我们的结果完善了尼安德特人序列有害且有利的基因组区域目录,并证明了尼安德特人的基因组残留物在迄今为止研究的每个现代人群中都得以生存。”

普林斯顿大学,华盛顿大学,西雅图大学和微软公司的Akey博士及其同事开发了一种新的计算方法,用于检测人类基因组中的尼安德特人血统。

他们的方法称为IBDmix,使他们首次在非洲和非非洲人口中搜寻尼安德特人的血统。

“这是我们首次发现非洲人的尼安德特人血统的实际信号。它令人惊讶地显示出比我们以前认为的更高的水平。”合著者卢普博士说。他是普林斯顿大学路易斯-西格勒整合基因组学研究所的博士后研究助理。

IBDmix方法的名称源于遗传原理“后裔身份”(IBD),其中两个人的DNA片段是相同的,因为这些人曾经共享一个共同的祖先。

IBD段的长度取决于这些人共享共同祖先的时间。

例如,兄弟姐妹共享很长的IBD段,因为他们的祖先(父母)只有一代被移除。另外,第四代表亲共享较短的IBD片段,因为它们的祖先(第三代祖父母)已被删除了几代。

研究人员将IBDmix应用到来自1,000个基因组计划的2,504个现代个体中,该个体代表了地理上的不同人群,并使用Altai Neanderthal参考来识别这些个体中的Neanderthal序列。

他们首次稳固地鉴定了非洲人的尼安德特人血统区域,在分析的非洲样本中每个人平均识别出尼安德特人序列平均17兆碱基(Mb)(约占基因组的0.3%),而不到一个兆碱基在以前的研究中报道过。

在非洲样品中鉴定出的尼安德特人序列中超过94%与非非洲人共享。

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