从RNA Seq分析Pro中表征独特的PMEPA1基因剪接变体
Sharad等人的图8“Oncotarget特征第4期”的封面介绍了“在前列腺癌中PMEPA1亚型(c,d和e)的生物学功能分类模型”。
除了报道的4种PMEPA1亚型外,还通过RNA序列分析从癌症基因组图谱数据集中对激素反应性VCa P,LNCa P细胞和人前列腺癌样品进行了RNA序列分析,鉴定出一种新型亚型PMEPA1-e。
研究人员分析了在前列腺癌和AR / TGF-信号转导的情况下PMEPA1-e亚型和特征较少的亚型c和d的结构,表达,生物学功能和临床相关性。
雄激素和AR诱导PMEPA1-e的表达。
综上所述,他们的发现首先定义了由PMEPA1-d和-e同工型介导的前列腺肿瘤发生,为前列腺癌预后评估和治疗的新策略提供了新见解。
李华博士和Shashwat沙拉德博士从中心前列腺疾病研究,外科,健康科学统一服务大学还有沃尔特里德国家军事医疗中心,贝塞斯达,马里兰州,美国在他们说Oncotarget文章,前列腺癌是美国最常见的男性恶性肿瘤,也是癌症相关死亡的第二大诱因。”
结果表明,PMEPA1基因启动子的甲基化导致了体内外前列腺癌细胞中PMEPA1的沉默。
在前列腺癌和非前列腺实体瘤(包括结肠癌,肺癌和乳腺癌)中,PMEPA1还被报道为TGF调节基因。
此外,最近的研究表明,通过以蛋白酶体独立的方式隔离SMAD2 / 3来激活TGF-信号转导,膜锚定的PMEPA1蛋白的丢失促进了前列腺癌的转移。
累积地,这些发现强调了PMEPA1基因的多功能性,并进一步表明了其表达和生物学功能取决于以细胞为中心的雄激素和TGF信号传导。
还显示了可变的剪接变体机制对于使肿瘤相关基因的功能多样化很重要。
此外,来自他们和其他小组的较早研究通过中断AR和/或TGF信号传导探索了PMEAP1基因同工型在前列腺肿瘤的发生和发展中的作用。
在这里,Oncotarget的作者专注于在雄激素和TGF信号转导的背景下定义被研究不足的PMEPA1亚型的表达,调控和生物学行为/功能,并进一步探索这些亚型在前列腺肿瘤中的临床意义和相关性。