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使用diaPASEF监视人类蛋白质组

导读 与数据无关的采集模式相比,数据无关的采集模式的主要优势是什么?主要优点是可重复性。独立于数据的采集使您可以跨非常大的同类组可重复地...

与数据无关的采集模式相比,数据无关的采集模式的主要优势是什么?

主要优点是可重复性。独立于数据的采集使您可以跨非常大的同类组可重复地测量单个分析物信号。这与依赖数据的采集相反,在数据采集中,您使用随机方法对分析物池中的肽进行采样。这样可以防止在每个单个样品中对同一肽库进行可重复的采样。

借助与数据无关的采集,您可以获得每个样品中特定分析物的定量答案,而且您没有这种随机因素会在定量数据矩阵中引入缺失值,而在缺失数据中您经常会看到与数据相关的采集。

什么是timsTOF Pro,您如何使用它来分析复杂的生物样品?

timsTOF Pro是一种新颖的仪器,基于传统的Q-TOF体系结构,但在光谱仪前还具有捕获离子迁移率设备。这允许我们做两件事:首先,它允许我们在将离子发送到分析之前在特定的时间段内积累离子;其次,它允许我们通过离子迁移率分离离子。

这意味着离子会集中在非常窄的离子带中,这会提高灵敏度并提供额外的细胞活性,因为离子将被其碰撞截面所分隔。

timsTOF Pro使用并行累积串联碎片(PASEF)采集方法,该方法利用捕获的离子迁移率将测序速度提高了10倍。它是基于使用四极杆的位置并将其与离子一起移动的。

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